La recolección de la muestra la realizará el paciente en un frasco estéril de boca ancha transparente, con capacidad para 30–50 mL que permitirá ver la cantidad y la calidad de la muestra de expectoración (flema), se deben recolectar la muestras de expectoración sin saliva, preferentemente en la mañana. Para ello, debe inspirar profundamente, reteniendo por un instante el aire de los pulmones y tratar de provocar tos para arrojar solo la flema, se tiene que repetir esta indicación por lo menos tres veces consiguiendo en cada una de ellas muestra, al terminar se tiene que entregar la muestra al laboratorio antes de cumplir las 2 hrs.de la recolección.