La muestra es de materia fecal, de preferencia la primera del día, si existe presencia de pus, moco o sangre recolectar de esa muestra para su entrega al laboratorio, la cantidad que se requiere es aproximadamente del tamaño de una nuez, la cual va a colocar en un recipiente de plástico que puede solicitar en el laboratorio o adquirirlo en farmacia y entregarlo en un lapso menor a 2 hrs. después de la recolección.
En muestras sólidas o semisólidas el paciente puede defecar sobre una superficie limpia y seca, como en una hoja de papel de estraza, plato desechable, bolsa de plástico o papel aluminio, nunca recolectar la muestra del escusado. En muestras líquidas recolectar directamente en el contenedor. No debe de aplicar pomada, talco o ungüentos el día de la recolección.
Para pacientes pediátricos que aún usen pañal:
Si las heces son sólidas o semisólidas, es aceptable defecar en el pañal y tomar la muestra de la parte que no tiene contacto con el pañal, no raspar el pañal, colocar la muestra en el contenedor de plástico con tapa de rosca para materia fecal. Si las heces son líquidas solicitar al familiar observar al paciente y en el momento de defecar recolectar la muestra en un contenedor de plástico con tapa de rosca para materia fecal.
No debe de aplicar pomada, talco o ungüentos el día de la recolección.